Υδροπονική καλλιέργεια σε κανάλια γεμισμένα με υπόστρωμα
Οι υδρορροές τοποθετούνται ή πάνω στο δάπεδο του θερμοκηπίου ή σε υπερυψωμένα υποστηρίγματα και γεμίζονται με υπόστρωμα. Συνήθως οι υδρορροές έχουν πλάτος 15 - 40 cm, ύψος 6 - 20 cm και μήκος που ποικίλλει, ανάλογα με τις διαστάσεις του θερμοκηπίου. Οι στενότερες υδρορροές (15 - 25 cm) χρησιμοποιούνται για φύτευση σε μονή γραμμή, ενώ για φύτευση σε διπλές ή πολλαπλές γραμμές απαιτούνται υδρορροές με πλάτος που υπερβαίνει τα 30 cm. Τα μεγάλου μεγέθους φυτά, όπως η τομάτα και το αγγούρι, μπορούν να φυτεύονται τόσο σε μονή, όσο και σε διπλή γραμμή σε κάθε κανάλι. Αντίθετα, τα μικρού μεγέθους φυτά που παραδοσιακά καλλιεργούνται σε βραγιές (π.χ. μαρούλι, ρόκα), ενδείκνυται να φυτεύονται σε φαρδιά κανάλια και να τοποθετούνται σε διπλές ή πολλαπλές γραμμές. Η τοποθέτηση των γεμισμένων με υπόστρωμα καναλιών πάνω σε υπερυψωμένα υποστηρίγματα ή πάγκους είναι σκόπιμη όταν καλλιεργούνται φυτά με ροδακοειδή ανάπτυξη, όπως το μαρούλι και η ζέρμπερα, ή άλλα φυτά χαμηλού ύψους, όπως π.χ. το τριαντάφυλλο ή το κολοκύθι.
Η καλλιέργεια σε υδρορροές γεμισμένες με κοκκώδη υποστρώματα δεν είναι σπάνια. Όπως και στην περίπτωση της καλλιέργειας σε φυτοδοχεία, η τοποθέτηση του υποστρώματος μέσα στα κανάλια απαιτεί επιπλέον εργατικά. Επομένως, η καλλιέργεια σε κανάλια γεμισμένα με ένα κοκκώδες υπόστρωμα είναι σκόπιμη μόνο όταν το τελευταίο διατίθεται χύδην σε συμφέρουσα τιμή στην αγορά, ή όταν η θερμοκηπιακή επιχείρηση διαθέτει εργατικά χέρια για την εργασία αυτή χωρίς επιπλέον κόστος. Στην Ελλάδα, το υπόστρωμα που χρησιμοποιείται κατά κανόνα χύδην μέσα σε κανάλια λόγω του πολύ χαμηλού του κόστους είναι η ελαφρόπετρα, η οποία έχει επιδείξει πολύ καλή καλλιεργητική συμπεριφορά σε αυτού του είδους τα συστήματα καλλιέργειας. Η καλλιέργεια σε κοκκώδες υπόστρωμα που είναι τοποθετημένο χύδην μέσα σε κανάλια μπορεί να παρουσιάσει προβλήματα ανομοιόμορφης υγρασίας κατά μήκος των γραμμών φύτευσης λόγω της κλίσης. Το πρόβλημα αυτό μπορεί να επιλυθεί είτε με χρησιμοποίηση καναλιών με διπλό πυθμένα είτε με τοποθέτηση μίας στρώσης χονδρόκοκκου υλικού στον πυθμένα των καναλιών για αποστράγγιση.